一、仪器简介

  PromethION是目前Nanopore产出中通量最高，处理样本数最多的台式测序仪，是大型项目和高通量实验室的理想选择。可以同时或单独运行48张PromethION 芯片（每张芯片3,000 个纳米孔通道），总计达 144,000 个纳米孔通道，并产出高达Tb级别的长读长测序数据。集成的高性能计算能力可实时进行碱基识别和后续分析，以便快速获得结果。

二、技术流程

  精简明确的文库制备——快至10分钟内，用条形码试剂盒进行多样本混样建库，同样的化学试剂和试剂盒适用于Flongle、MinION、GridION X5和PromethION——先在MinION或Flongle上检查样本质量，然后再在PromethION上运行实验。

三、仪器特点

  • 自定义适合您的实验——使用单个测序芯片或组 合多个测序芯片来获得更多数据

  • 按需选择实验开始的时间——无需等待设备满载

  • 独立控制每个单独的测序芯片——能够同时运行 任意数量的测序芯片，或者在其他测序芯片运行 时增加运行更多测序芯片

  • 读长取决于您的样本和实验需要——无需片段化样本，从而使组装、结构变异识 别和单倍体分型（ phasing ）更容易

  • PromethION直接对DNA和RNA进行测序 ——意味着无扩增偏差，并保留修饰信息

  • PromethION数据采集设备包含最先进的碱基识别 加速器，能提供超过200 (P24) 或 400 (P48) TFLOPS的计算能力

  • 使用我们其中一个直观的工作流程EPI2ME ： 能实时开始种属鉴定和人类基因组比对等分析

  • 选择输出原始信号或碱基识别.fastq文件，这样就可以使用您自己的定制分析流程

四、应用范围

  • 大基因组拼接：避免了二代测序需要拼接的特点，大基因组的拼接大大提高了基因组的完整性

  • 全长转录组：可以直接测序RNA，直接识别RNA的碱基修饰；可以准确识别各基因的多个同源异构体，简单准确

  • 大片段结构变异：更准确的检测结构变异（如缺失、倒位和易位等）

  • 微生物快速鉴定：可以在采集点直接进行测序，实时得到序列信息进行物种分类鉴定，完成微生物的快速鉴定